1、其一，深層的分裂局面。這一時(shí)期，真正意義上的統(tǒng)一只有21年，即280年司馬氏滅吳，到301年“八王之亂”全面爆發(fā)。而即便是這21年，西晉也沒有恢復(fù)東漢盛時(shí)的版圖：鮮卑基本已據(jù)有匈奴舊地，并日益南下；渭北高原以北至河套已為羌胡所占；內(nèi)徙的匈奴人實(shí)際已控制了今山西的北部。西晉以前，有三國(guó)的鼎立；西晉以后直到隋朝統(tǒng)一，長(zhǎng)江流域與黃河流域始終分屬不同的政權(quán)，黃河流域更是始終存在兩個(gè)以上的政權(quán)，甚至同時(shí)有十多個(gè)政權(quán)存在。在政局或南北分裂或東西對(duì)峙或地區(qū)割據(jù)的長(zhǎng)期影響下，各別地域的經(jīng)濟(jì)、文化、學(xué)術(shù)、政治乃至心理，也逐漸“地域”色彩濃厚，“地域”獨(dú)立趨勢(shì)加強(qiáng)。地域意識(shí)的強(qiáng)化與地域傳統(tǒng)的生成，也是一種“分裂”。又即便在同一政權(quán)的內(nèi)部，也有著明顯的地區(qū)軍事割據(jù)傾向，如東晉南朝的州鎮(zhèn)，北朝的鎮(zhèn)戍，這既造成了中央與地方的爭(zhēng)衡、內(nèi)外的對(duì)抗，也進(jìn)一步加深了魏晉南北朝大分裂局面下的地區(qū)割據(jù)與對(duì)抗傾向。

2、其二，復(fù)雜的民族關(guān)系。四周的邊疆民族南下北上、東進(jìn)西入，遷徙頻繁，造成民族成份復(fù)雜，民族融合（自然的融合與強(qiáng)制的融合即戰(zhàn)爭(zhēng)）加速，民族戰(zhàn)爭(zhēng)劇烈，民族更替迅速。北方地區(qū)的主角是入主的“五胡”與留居的漢族，在北方整體“胡化”的同時(shí)，是頗多艱難曲折的胡人的逐漸“漢化”；在南方，則特別表現(xiàn)為退守南方的北方漢族與南方漢族以及越蠻俚僚的自然融合與強(qiáng)制融合，這也是一種“漢化”。如果再考慮到周邊特別是蒙古高原、東北、西域的民族，則魏晉南北朝歷史實(shí)際是由北方邊疆民族（重要者先后有鮮卑、羌胡、高句麗、柔然、高車、突厥等）、中原地區(qū)（曹魏、西晉、十六國(guó)北朝）、南方六朝三大地域所構(gòu)成的。其間地域?qū)?、民族興衰、社會(huì)轉(zhuǎn)型、制度沖突、文化融匯等等，異常復(fù)雜。

3、其三，頻繁的人口遷移。這特別表現(xiàn)在東晉十六國(guó)南北朝，當(dāng)時(shí)人口遷移的規(guī)模之大、范圍之廣、歷時(shí)之久、影響之深，超過以前任何一個(gè)歷史時(shí)期。而十六國(guó)北朝內(nèi)部的人口流動(dòng)與東晉南朝的僑流人口，又多有不同。如東晉南朝境內(nèi)的僑流人口，多為主動(dòng)遷徙而來，成為定居移民的比例較大；東晉南朝尤其是東晉、宋、齊、梁政權(quán)，實(shí)質(zhì)上為移民政權(quán)，以此，僑流人口的地位高，政治、軍事、文化影響大，受到的優(yōu)待也多。十六國(guó)北朝特別是十六國(guó)，漢族以及其他非統(tǒng)治民族的非漢族之頻繁而大規(guī)模的人口流動(dòng)，是由胡族統(tǒng)治者實(shí)施的，并且以強(qiáng)制遷移性質(zhì)為主，他們不僅地位低下，而且境況往往悲慘，胡族統(tǒng)治者強(qiáng)制遷移他們的目的，是以之為兵、用之耕耘；而隨著政權(quán)的興亡更替、時(shí)局的動(dòng)蕩混亂，此被強(qiáng)制遷移的人口，又被不同的統(tǒng)治者屢次遷移，所以能夠長(zhǎng)期定居下來的移民其實(shí)數(shù)量有限。