口腔潰瘍目前病因不明，存在明顯的個體差異。

1、消化系統(tǒng)疾病及功能紊亂

患系統(tǒng)性疾病的患者易發(fā)生口腔潰瘍，主要是通過影響免疫系統(tǒng)而致病?？谇粷兣c胃潰瘍、十二指腸潰瘍、潰瘍性結腸炎、局限性腸炎、肝炎等有關。其

2、內分泌變化

有些女性患者往往在月經期發(fā)生，可能與體內雌激素量下降有關。月經期出現(xiàn)口腔潰瘍主要是由于體內黃體酮水平增高而雌激素(孕酮等)的水平降低所致。

3、精神因素

有的患者在精神緊張、情緒波動、睡眠狀況不佳的情況下發(fā)病，可能與植物神經功能失調有關。

4、遺傳因素

如父母雙方均患有復發(fā)性口腔潰瘍時，其子女約有80— 90%患病，若雙親之一患此病時，其子女約有50—60%患病。